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新疆生地所搭建全球首個(gè)耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

2024-01-08來(lái)源:新疆日?qǐng)?bào)

石榴云/新疆日?qǐng)?bào)記者謝慧變從中國(guó)科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所獲悉:新疆生地所在干旱區(qū)生物種質(zhì)資源收集和保育平臺(tái)建設(shè)方面取得重要進(jìn)展,已搭建全球首個(gè)耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù),為我國(guó)干旱區(qū)生物多樣性保育和可持續(xù)利用提供了重要科技支撐。這是新疆生地所5日發(fā)布的2023年重要科技進(jìn)展之一。

耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)包含26套營(yíng)養(yǎng)體耐脫水相關(guān)植物基因組數(shù)據(jù)資源,其中10套為苔蘚植物的基因組。

記者了解到,耐脫水被認(rèn)為是陸地植物中一種古老且極為罕見(jiàn)的性狀,主要存在于種子和孢子等繁殖體中。耐脫水植物具有“干而不死,遇水復(fù)蘇”的典型特征,被認(rèn)為是植物界中的“三體人”。

耐干苔蘚就是耐脫水植物的一種。耐干苔蘚廣泛分布在古爾班通古特沙漠,覆蓋在沙子表面,被譽(yù)為“沙漠地毯”,遇水后能在3秒內(nèi)迅速變綠,對(duì)維持沙漠穩(wěn)定性有很好的作用。

新疆生地所研究員張道遠(yuǎn)團(tuán)隊(duì)研究發(fā)現(xiàn),沙漠極端的環(huán)境造就了耐干苔蘚超強(qiáng)的耐干燥、耐高溫等綜合抗逆性,也成為挖掘抗逆基因的好材料。

新疆生地所副研究員高貝介紹,過(guò)去十年,測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步與普及應(yīng)用使我們有機(jī)會(huì)深入研究這類耐脫水植物的基因組及其演化特征。然而,尚未有專門的綜合數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)整合這些寶貴的基因組資源。

新疆生地所研究員張道遠(yuǎn)團(tuán)隊(duì)基于對(duì)脫水植物基因組學(xué)研究多年的積累,搭建的全球首個(gè)耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù),整合了豐富的生物信息學(xué)分析工具模塊,如多種類型的序列比對(duì)、同源基因簇搜索等,為相關(guān)研究人員對(duì)該類植物的基因數(shù)據(jù)資源整合、發(fā)掘和利用提供了參考。

干旱區(qū)具有豐富的抗干旱、高溫、鹽堿等逆境的生物種質(zhì)資源,建設(shè)干旱區(qū)生物種質(zhì)資源庫(kù),對(duì)種質(zhì)資源的收集保育、研究及開(kāi)發(fā)利用至關(guān)重要。